Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms