Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CtshP49935 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CtshP49935 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CtshP49935 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CtshP49935 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CtshP49935 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CtshP49935 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms