Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VegfbP49766 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VegfbP49766 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms