Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PtpreP49446 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpreP49446 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms