Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms