Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VdrP48281 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VdrP48281 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms