Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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