Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tjp1P39447 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tjp1P39447 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms