Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rom1P32958 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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