Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsx2P31316 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gsx2P31316 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gsx2P31316 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gsx2P31316 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gsx2P31316 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gsx2P31316 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gsx2P31316 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms