Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cd28P31041 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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