Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VtnP29788 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VtnP29788 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VtnP29788 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms