Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc6a9P28571 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms