Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms