Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U2af2P26369 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms