Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NdnP25233 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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NdnP25233 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NdnP25233 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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