Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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