Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ggta1P23336 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms