Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PparaP23204 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PparaP23204 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PparaP23204 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms