Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RarbP22605 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RarbP22605 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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