Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms