Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcer1aP20489 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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