Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pou5f1P20263 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms