Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VimP20152 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VimP20152 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VimP20152 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VimP20152 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VimP20152 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
VimP20152 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VimP20152 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VimP20152 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VimP20152 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms