Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfaP20033 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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