Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnnc1P19123 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnnc1P19123 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnnc1P19123 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnnc1P19123 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tnnc1P19123 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms