Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P18528 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P18528 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms