Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18526 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18526 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms