Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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PcnaP17918 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms