Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms