Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DmdP11531 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DmdP11531 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DmdP11531 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DmdP11531 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DmdP11531 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DmdP11531 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DmdP11531 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DmdP11531 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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DmdP11531 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DmdP11531 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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DmdP11531 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DmdP11531 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms