Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PolP11369 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP11369 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP11369 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP11369 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms