Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms