Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm3P0DP28 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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