Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtaP09225 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms