Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb1P09055 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms