Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfrbP05622 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PdgfrbP05622 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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