Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Lamc1P02468 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamc1P02468 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamc1P02468 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lamc1P02468 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms