Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms