Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms