Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Casq1O09165 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq1O09165 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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