Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Eftud2O08810 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms