Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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