Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm8356J3QPD3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms