Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm2035J3QP87 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm2035J3QP87 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm2035J3QP87 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm2035J3QP87 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm2035J3QP87 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2035J3QP87 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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