Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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