Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm20918J3QN17 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm20918J3QN17 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm20918J3QN17 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm20918J3QN17 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm20918J3QN17 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20918J3QN17 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm20918J3QN17 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20918J3QN17 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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