Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms