Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm11236J3QMS7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Gm11236J3QMS7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm11236J3QMS7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm11236J3QMS7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm11236J3QMS7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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