Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms